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1、2024呼吸道病原体检测的临床意义01呼吸道合胞病毒呼吸道合胞病毒(RSV)为单股负链RNA病毒,是全球范围引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染(ALRTI)最重要的病毒病原体。据报道,出生后第1年内约70%儿童感染RSV,几乎100%的儿童在2岁时感染过RSVoRSV的平均基本传染数(RO)为4.5,传染性强。RSV传播的主要方式是呼吸道飞沫传播及直接接触传播,包括鼻黏膜或眼结膜接触被病毒污染的分泌物或吸入2m范围内感染患者的直径5m、含病毒的呼吸道飞沫等。抗RSV特异性IgM抗体最早可在发病1周左右出现,特异性IgG抗体在急性期阴性而恢复期转为阳性,或恢复期特异性IgG抗体滴度较急性期IgG抗
2、体滴度升高4倍及以上,提示疾病过程有RSV感染。临床意义:1 .婴幼儿急性下呼吸道感染据柳叶刀荟萃分析显示,2019年全球060月龄儿童中,360万例RSV相关急性下呼吸道感染住院,其中约140万例(39%)发生在06月龄婴儿中,约有90万(26%)患有低氧血症。另外,06月龄儿童组因RSV死亡的发生率为2.0%,28天6月龄儿童因RSV死亡的发生率高达3.6%o重症RSV感染不但可以引起全身多个组织器官功能障碍,也与感染后期婴幼儿反复喘息、哮喘发生密切相关。2 .老年人RSV感染据研究显示,在没有潜在健康状况的老年人中,RSV发病率随着年龄的增长而增加。在患有慢性心肺疾病的住院成人中,8%1
3、3%的人在冬季或偏肺病毒季节感染RSVo老年人因呼吸道合胞病毒住院治疗通常持续36d,其中相当大比例需要入住重症监护病房并进行机械通气。在因RSV住院的老年人中,死亡率为6%8%。Pw10,000age-specificpopulation图1按RSV就诊类型划分的特定年龄人群的RSV发病率02肺炎支原体肺炎支原体(MP)是常见的社区获得性下呼吸道感染病原,占社区获得性肺炎的10%40%,在部分封闭人群中可高达70%。据研究,MP感染每23年大约有1次流行,流行季节多在秋冬季,春季的发病率较低,且年长儿MP感染率较小年龄儿童高。肺炎支原体肺炎(MPP)患者多伴随头痛、发热、咳嗽等症状,除此之外
4、,全身各系统均可受累,包括神经、血液、泌尿、消化、循环、皮肤及关节肌肉等,严重者可引发多系统、多器官的肺外并发症,危及患者生命安全。肺炎支原体感染后,机体会产生IgMxIgG等特异抗体,这是机体清除支原体的重要方式之一。IgM出现在机体感染肺炎支原体1周后,3周左右到达最高浓度后逐渐降低,可持续出现24个月JgM滴度增高到一定效价(如1:320)可作为MPP的诊断指标。研究显示,IgM对感染早期、免疫力低下老年患者往往滴度较低,且IgM抗体敏感性为1323,与受检者个体差异、MP感染不同阶段等相关。IgG出现在机体感染肺炎支原体20天后,其滴度在1:16以上认为有临床意义,且病情越重JgG阳性
5、率越高。另外,患者恢复期血清IgG滴度较急性期增加4倍可协助诊断急性支原体肺炎呼吸道感染。需要注意的是MP抗体检测阴性有可能为窗口期或感染时间较长导致抗体逐步消失,不能排除支原体感染。03流感病毒流感是一种急性发热性呼吸道传染病,具有传染性强、传播速度快、传播范围广等特征。流感病毒作为正黏病毒科中的唯一种类,含有8个独立的单股负链RNA基因片段。流感病毒根据血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA这两种病毒表面糖蛋白的抗原性差异可进一步分出亚型,如HIN1、H2N2、H3N2,均可导致人类流感大流行。甲、乙型流感病毒血清学的检测方法特异度相对较高,需要对患者急性期和恢复期的血液分别进行采集,对于恢复期
6、患者血清的流感病毒中和抗体滴度较急性期升高4倍及以上,可进行流感诊断。1 .甲型流感病毒甲型流感病毒属中的禽流感病毒(AIV)可引起人类感染,常见的亚型包括H5N1-H5N9xH7N1-H7N9.H9N2o甲流感染常见的症状包括发热、畏寒、头痛、虚弱、眼睛发红、咽喉痛、干咳和流涕,病毒性肺炎为其常见并发症,在高危人群中可能更为严重或危及生命。目前在人类中传播的季节性甲型流感病毒多为H1N1和H3N2亚型,自1918年以来,来自禽类或猪群的甲型流感病毒已经导致了4次全球范围的人类大流行,均造成高病死率。据报道,2010-2017年,美国疾病预防与控制中心估计流感病毒感染已导致920-3560万人
7、患病,14-71万人住院治疗。2 .乙型流感病毒乙型流感病毒的宿主范围和流行模式与甲型流感病毒较为相似,但从未引发人类大流行。与甲型流感病毒相比,乙型流感病毒所引起的临床症状相对较轻,发病开始常有一般的流感症状,如起病急骤,咳嗽、咽痛伴有发热、头痛、肌痛、严重时可出现高热不退气急、发绢等。人感染乙型流感病毒后,也易造成严重疾病甚至导致患者死亡,有数据显示,每年乙型流感病毒感染病例占所有流感病例的23%。此外,在儿童中,乙型流感病毒感染占所有流感相关死亡的52%0SgnorSymptom*InfluenzaTypebSeasonalAS2142)Influenza(1248)UnaustedOR
8、Austed0ReSystemicFeverHeadacheldharyRespiratoryCoryzaCoughWheezingRespiratorydistressApncaExtrarespiratoryAbdominalPatf)VomitingaMordarrcaand/ordehydrationMyalgtdArthralgiaSeizure1990(929)1167(935)110(085-14一78(S123(99)289(2.16-38818S(1M-2S2741046)465(373)112(097-1301277(596)7444763709(05-1.47)119(5
9、6)126138(IX)S-1811003(469)569(45S)095(083-11038102(82)493(K377.20)319(216M72)UHoS)15,12)259(11fr-5791958S-440238111)116(93)082(OeS-I(M)图2按流感类型分类的住院病人体征和症状TreatmentInflueruaType-SeasonalA-1510)UnadjustedOR/PAdjustedOfVQAntiviralAntibiotic42643(15.1)202/1508(134107(072-104)Measuresofillnessseventy1913
10、/2640(725)1050/1508(696)087(076-100)RespiratorycomplicationsCroup101(38)51(34)088(062-124)Pneumonia(radologcallyfirmed)595(225)364(241)109(094-127)ExtrartspiratorycomplicationsMyositis18(07)101(8.7)1046(631-1735)695(415-1IM)Myocarditis6(0.2)6(04)175(0SG-545)Hepatitis24(09)22(U)161(090-289)Menmgrtis6
11、(0.2)4(03)117(055-415)Encephalitis42(16)36(2.4)151(097-237)Lengthofhosptalstay,medianOQW.d30(20-50)30(20-O)060MortalityAnnbutBbletoinfluenza10(04)16(11)282(128-23)265(118-5941AIRauseW(04)18(1318(I4G-69O)295(134-649)AdmittedtoKXJ337(12.7)190(126)099(082-119)RequiredmechanicalVentlIatIOnC212(62.9)124(
12、KJ)1.11(076-161)RequiredextracorporealmembraneOXygenatIOnC7(2.16(32)154(0.51-4.64)一LengthofKUstay,median(IQR).dc3(HIg5)3D(IA7.01062图3不同流感类型住院患者的治疗和病情严重程度04人偏肺病毒人偏肺病毒感染是人体感染人偏肺病毒(HMPV)后引起的一种急性呼吸道传染病,全年散发,多发生于冬末及春初。HMPV感染大多表现为轻度自限性疾病,部分患者因出现毛细支气管炎、肺炎、慢性阻塞性肺疾病(COPD)急性加重和支气管哮喘急性发作等并发症需要住院治疗,免疫功能低下者可进展为重
13、症肺炎,出现急性呼吸窘迫综合征(ARDS)或多器官功能不全等,甚至导致死亡。据人偏肺病毒感染诊疗方案(2023年版)提出:有HMPV感染相关临床表现者,具有以下一种或以上病原学、血清学检查结果可作出诊断1) HMPV核酸检测阳性;2) HMPV抗原检测阳性;3) HMPV培养分离阳性;4) IgG抗体转为阳性或恢复期IgG抗体水平为急性期4倍或以上升高。注意:HMPV病毒抗原检测阴性不能排除诊断,血清学检测IgM抗体敏感性和特异性较低,HMPV核酸检测的敏感性和特异性高。05人副流感病毒人副流感病毒(HPIVs)是常见的呼吸道感染病原体,分为HPIV1-4四个血清型,其中HPIV-4又分为HP
14、IV-4A和HPIV-4B两种亚型,HPIV-1和HPIV-3为呼吸道病毒属,HPIV-2和HPIV-4为腮腺炎病毒。抗HPIVs特异的IgM抗体最早可在发病1周左右出现,针对HPIVs各型的抗体之间有交叉反应,可通过比较抗体滴度进行区分。HPIVs是继RSV后引起儿童急性呼吸道感染的又一常见病毒,血清学调查显示绝大多数6-10岁儿童曾感染过HPIVso在一项儿童癌症中心的研究中显示,HPIVs的检出率为26%,仅次于RSV(45.45%)。HPIVs感染呈全球性分布,在不同地区、不同年份的流行病学特征不同,可能与气候条件差异有关。HPIVs的流行特征与亚型有密切关系。MonoirfectonCanfecton图4在呼吸道样本中检测到的病毒比例06腺病毒人腺病毒(HAdV)自1953年第一次从健康人群腺样体细胞培养中被首次发现以来,截至2019年7月,已鉴定并分离100多个分型,常见的致病亚群及疾病见表2。腺病毒典型临床特征包括发热、咳嗽、咳痰,偶伴腹泻等非特异性呼吸道感染症状。HAdV感染的潜伏期中位数为5.6d,IgM抗体在发病一周左右