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1、PDF相关推文(建议分三次发订阅号服务号一次转发)刘源(作者中科大刘博士)一、PDF以及实验基础理论标题:同步辐射全散射PDF(第一期)PDF以及实验基础理论1.1 什么是PDF和RDF众所周知,结构的测试方法有多种,如核磁共振(NMR)、穆斯堡尔谱学和衍射法,其中的NMR和穆斯堡尔谱学是用于检测局域有序的核物理方法。然而,作为更大范围使用的衍射法(包括有XRD、中子衍射、电子衍射以及同步辐射等),其关键的分析技术就是原子的分布函数法。分布函数是一个统计物理学的概念,表示在一个原子附近的径向原子分布状态,一般有三种形式:径向分布函数(RadialDistributionFunction,RDF
2、)、双体分布函数g(r)(PairDistributionFunction,PDF又称对分布函数)以及约化径向分布函数G(r)RDF=4仃2p(1.1)g=P/Po(1.2)G(r)=4rp(r)-(1.3)其中:P(T)为原子径向分布的原子数密度(径向密度函数);r为原子的径向分布函半径;Po为系统中的平均原子数密度。首先了解的是径向密度函数p(r),如图1.1所示,径向密度函数表示距离中心原子r的球壳体积4万/力的原子数密度,于是当r够大的时候p(r)趋近于平均数密度Po;而RDF的物理意义是:描述与原子距离在r到/-dr范围内的平均原子数;对分布函数g(r)表示原子的分布偏离平均数密度程
3、度的标志,离原子位置越近,这种偏离越明显;G(r)没有具体的物理意义,和原子密度有关。图1.1原子结构与径向密度函数的关系示意图我们使用最多的是对分布函数PDF,对于N元体系来说,就有N(N-I)个偏双体分布函数:Z?Ifng广瓯倍%/4立力(1.4)其中:L为立方构型的边长;MNj分别为i,j原子的个数;%(r)表示r到r+dr范围i原子周围j原子数量对于PDF的函数图的分析,可以得到非晶合金结构的重要参数比4如图1.2所示两种不同的材料状态的对分布函数。A最近邻原子平均距离:双体分布函数第一峰位值即为最近邻原子平均值;B最近邻配位数:CN等于PDF函数的第一个半峰面积的两倍,即:CN=2,
4、r1prdr(1.5)%C原子的平均位移:位移等于RDF函数一个半峰宽度的1/2.36倍;D有序畴尺寸:在双体分布函数约等于1,即为有序畴边界,考虑实验误差一般取g(r)=1.02时的r对应有序畴尺寸;E第一峰的高度和形状可以反应原子之间的结合强度,如峰表现为尖锐,表明在此半径范围内的原子数密度比平均密度要高很多,中心原子与最近邻原子的相互结合强度也比较大;F第一峰与第一谷的关系通过经验性的方法,可用来确定玻璃转变点。图1.2对分布函数1.2 静态结构因子静态结构因子(StatiCStrUCtUreFaCtor,SSF)是一个连接实验分析与模拟分析的重要参量。对于衍射分析来说,它表征的是材料对
5、射线的散射能力,反映结构的平均信息。结构因子S(Q)可以和上述的PDF相互转化(互为傅里叶变换):ozl ()-lsin(r)j(1.6)Sa(Q)=I+带Idgwb)-Usin(r)Jr(1.7)其中:Q=色酶,波矢;同时,由衍射实验可以得到总结构因子,利用Faber-Zimman公式网,结构因子为:5(Q)=/0-(1.8)其中:2为入射波长=ZJ2(Q),2=(Q)2为原子散射因子I(Q)为XRD实验所得强度归一化的衍射强度。总结构因子和分结构因子之间的关系为:S(Q)=EE常端S”(Q)(1.9)aI乙JaJa)其中:%”为摩尔分数同理,如为中子散射,则将原子散射因子换成中子散射长度;
6、若为电子散射,则替换成相应的散射因子。1.3衍射实验X射线衍射技术(X-rayDiffraction,XRD)是材料分析的最常用手段之一。对于晶体材料,XRD测量布拉格衍射峰,提供样品的物相和晶体结构信息。X射线衍射是属于散射的一个特例了,是相干散射,强调入射波与目标物质发生相互作用后传播方向变化的过程,且衍射偏向强调波被周期性结构散射后的结果。对纳米材料、半晶体、非晶、液体等材料,衍射的相干性降低,同样的进行XRD过程,我们称为X射线散射。所以,散射衍射本质上是同样的东西作用于不同物体上的不同称呼,没有本质的差别。从散射的空间分布的剖面看,不强调某个特定方向的时候泛称散射,而要强调某个特定的
7、模式、方向的分布时则说衍射。弹性散射是指在散射中没有频率位移、无能量损失,也就是相干散射。而非弹性散射,也就是说散射后不但能量改变,方向也有变化,如Compton散射。我们在获得PDF的时候需要的就是相干散射数据,所以称为X射线全散射实验(X-raytotalscattering),其操作方式、原理和XRD相同。二、实验到PDF标题:同步辐射全散射PDF(第二期)从实验到PDF数据处理I附实操演示2.1 PDF与全散射我们利用实验室XRD可以得到衍射图谱,进而得到晶体材料的结构信息。但是对于非晶等材料,常规XRD分析仅能获得宽化的衍射峰或背景包,无法得到有意义的结构信息,如图2.1中右所示。(
8、n) A=SU32040602 Theta (degree)图2.1晶体(左),与非晶合金(右)XRD图谱根据上章节所说的原子对分布函数(PDF,Pairdistributionfunction)(可插入超链接),描述了在所研究材料中发现距离为r的一对原子的概率。此方法以高能硬X射线测量样品广角全散射数据,因此也称为Totalscattering全散射分析,同时对布拉格衍射峰和漫散射进行归一化和傅里叶变换等处理,不仅提供长程(10nm)原子有序性信息,还提供材料中短程结构信息,如短程有序/无序排布、键长、局部缺陷等。通过对不同状态的同类样品的PDF数据进行差异化分析,还可以进一步研究过程中材料
9、精细结构的变化,获得材料物理性能或化学性能的变化与材料结构变化之间的关系,深入研究变化/反应过程机理。PDF极大拓展了X射线结构表征的分析范围,样品不再局限于晶态材料,非晶、液体等均可测量。2.2 如何获得的PDF获得PDF数据有三个步骤,如下图2.2所示:1 .对样品的全散射数据进行校正,包括背景(对空白样品容器进行同样条件的单独测量获得)、康普顿散射、探测器死区时间、吸收、衍射几何和偏振;2 .对校正后的X射线散射数据进行归一化,计算简化结构函数S(Q);3 .对结构函数进行傅里叶变换,得到原子对分布函数g(r)。衍射数据修正及归一化FOUrier 变换纽带OZ OL 0 OZoLo7S
10、6匚O- 0 7SS94;TSIn(6)-05101520r (A)原子间距离约化径向分布函数:G(r)=4rr)-p0图2.2PDF计算过程注意事项:A在结构函数S(Q)中,低Q部分的数据主要为布拉格散射的尖锐强峰,它们对应于材料中原子的长程排序;在高Q值部分,布拉格散射峰基本消失,强度极低的漫散射宽峰才可以识别出来久因此,数据的Q值范围足够大,才能获得尽可能多的漫散射信号。B由于Q=4csin0,为获得尽可能大的Q值(QmaX)的原始数据,PDF实验要求使用尽可能短波长的X射线,并且测量角度范围(2。)应尽可能大。这样在最终计算出PDF函数时,实空间的分辨率也会更好。此外,由于漫散射信号强
11、度比布拉格散射峰信号强度低5-6个数量级,在测试时一般需要对全谱数据进行分段测量,在高角度(高Q部分)使用足够长的测量时间来获得足够强度和信噪比的清晰、平滑的高质量原始数据。总结:实验需要短波长和高强度的光源,且在实验时需要保证光源波长远小于或稍微长于测试元素的吸收限。在实际工作中,同步辐射光源和加速器线站天然具有高强度多波长的射线源,因此经常在粉末衍射线站搭建PDF光路,使用单色器选取短波长高能射线进行PDF实验,欧洲光源(ESRF)等还有专用的高能PDF线站(IDll)用于实现更高QmaX和测量效率的PDF数据。对于整个测试数据的归一化处理数据可以参考黄胜涛老师的非晶态材料的结构和分析以目
12、前多采用的软件为PDFgetX2,或者PDFgetX3叫2.3实例操作过程演示:同步辐射X射线衍射(XRD)实验在澳洲的ANSTO光束线上进行。由于实验设备的限制选取了17KeV能量的X射线,以保证不会出现重金属的强烈吸收导致的荧光,从而进一步对背底进行干扰。在相同的实验条件下,对装材料的毛细管进行测试,获得背景数据。利用jade软件去除毛刺。然后,扣除背底、样品吸收,极化以及集合系数校正,并对非相干散射(COmPton散射)和多重散射进行消除,得到最后的相干散射强度I。11(Q)o(n E) AalSU=UI图2.3背景拟合曲线第一步,如图2.3,对背景进行拟合,由于同步辐射伴随加压过程,所
13、以在前端低角度区域的强度比较高。第二步,将去除毛刺的数据和背景数据带入PDFgetx3PDFgetX3,PDFgetN3andPDFgetS3DiffPydocumentation(网址hups:WWW.diffDY.orDroducWodfaex.himloifelx3-and-xlfgen3)中进仃归一1化.处理,这里PDFgetX3相对于上一代程序更为方便的有了python的交互操作,操作更加的简洁。PDFgetX2需要虚拟机器才能运行,但是有独立的界面。利用PDFgetX3的处理方法有多种,详情可以参考PDFgetX3的manul,这里展示的是一种简单具体的方法。安装好软件后,打开Sh
14、el1,输入:pdfgetx3-Createconfig=filename.cfg”创建一个全新的输入文件iBC:WindowsSy$tem32cmdxe-OXIicrosoftWindows10.0.22000,556(c)MicrosoftCorporation保留所有权利C:UsergliuyuanDesktop新建文件夹(2)pdfgetx3createconfig=test.CfgVARNIIiG:test,cfgalreadyexists.VARNINGzUsex*-forcezyeszrtooverwrite.C:UsersliuyuanDesksp新建文件夹(2打开文件后对内部
15、参数进行修改调整:Dataformat=twotheta,uQA,Qnm输入的强度数据的横坐标单位inputfile=XrayfileO1.chi输入文件的名称backgroundfile=f11ename”背景文件名(若没有可以去掉这一项)bgscale=1背景强度的调整,默认为1output=输出的文件名字outputtype=fq,gr,iq,sq输出的数据的类型force=yes建议把强制打开,可以强行执行,覆盖前面的数据mode=xray选择实验的类型,中子散射或者X射线散射wavelength=0.7288实验波长,单位是埃,需要在输入文件的横坐标为角度时使用composition=Cu56Zr44材料成分rpoly=0.63F(Q)校正多项式中最大频率的r限值(这个后续还可以调整)qmin=0.8qmax=20傅里叶变化的范围单位埃qmaxinst=