脓毒症休克ARDS专病数据库建设项目需求.docx

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1、脓毒症/休克/ARDS专病数据库建设项目需求一.项目名称项目名称：脓毒症/休克/ARDS专病数据库建设二.项目内容供应商按照采购商需求，建设脓毒症/休克/ARDS专病数据库，满足收集ARDS及相关器官衰竭患者的临床数据，对收集的数据进行建模以及数据分析等需求。序号名称配置描述数量1脓毒症/休克/ARDS专病数据库配置详见3.11个三.详细功能描述3.1脓毒症/休克/ARDS专病数据库序一级功能模块二级功能模块功能描述1数据结构化数据标准化平台参考以下国内、国际、行业、指南等标准(包括但不限于)，对采集数据进行标准化处理，并反馈给业务系统：(1)卫健委数据标准：中国卫生信息数据元值域代码WS36

2、4X2011、电子病历基本数据集WS445.X-2014、医疗机构诊疗科目名录、中国卫生信息数据元、电子病历基本数据集(2)国家相关数据标准：GB/T2261.1-2003个人基本信息分类与代码、GBZT4671-2008家庭关系代码一(3)相关术语标准：国际疾病分类第九版临床修订第三卷：手术与操作ICD-9-CM-3、国际疾病分类第10版ICD-10国际疾病分类肿瘤学专辑第三版ICD-O-3、观测指标标识符逻辑命名与编码系统1.oINCV2.42、SNoMEDCT、MESH-(4)相关疾病诊治指南：参考ICDj0、急性呼吸窘迫综合症管理指南ARDS患者机械通气指南急性呼吸窘迫综合症的发生机制

3、级治疗的研究进展等(5)HL7CDA文档：HL7ChinaCDA规范试行2013版(6)药品词典规范：NMPA,ATC分类一自然语言处理技术要求(1)自然语言处理引擎需结合NLP技术、医学术语库、医学知识图谱、深度学习技术等前沿技术，可以对临床自由文本数据进行语义解析与后结构化处理，可以将数据处理为key-value形式的数据；可以持续处理接入到系统中的临床文本数据。结构化后的数据，需要包含人口学信息、重点疾病确诊信息、疾病相关因素信息、就诊症状与诊断信息、实验室检验信息、病理、手术、化疗、医嘱用药模块；(2)支持文本分句、分词能力支持自然语言分词能力；分词使用的医学专业词库种类多样；(3)支

4、持关键术语提取与医学术语本体构建技术需使用深度学习技术，对医学自然语言实现语义解析和结构化提取；结合自建中文医学术语与中文医学知识图谱，在解析文本语义的基础上，识别并构建医学术语本体，支撑后续信息逻辑抽取与信息网络架构；(4)支持自然语言识别建模与文本结构化支持基于医学术语本体构建以及进一步文本信息逻辑抽取与网络架构搭建的结果，进行自然语言识别建模，全面解析自然语言文本中的全量信息，建立语义解析模型。并在语义模型的基础上，有效提取疾病相关关键信息，进行语义推导与结构化输出；结构化模型可以在医院的临床数据中进行持续的训练，不断地提升准确率；(5)支持文本标准化处理与输出自然语言结构化提取结果，需

5、可以参照医学术语标准或医学知识图谱进行表述的标准化和归一；(6)支持BERT、ELMoPoinierNenBi-LSTM、TransformerCRF等前沿技术进行自然语言处理；(7)影像学报告解析，能够支持对CT、MR、超声等重点疾病诊断和疗效评估相关的影像学检查报告进行全量信息的结构化表达；(8)支持微生物报告解析：能够对微生物报告进行全量信息解析；(9)支持手术信息等的解析、提取、标准化；(10)支持提取诊断、实验室检验、药品等结构化临床信息，并参照相关数据标准进行标准化归一；(11)治疗方案的识别与结构化，能够基于自然语言处理技术和医学知识图谱技术，使用出院小结、医嘱等数据对患者的治疗

6、方案进行归类总结和结构化表达；(12)基于自动摘要实现病情总结，能够基于自然语言处理中的段落摘要技术，对现病史、病程记录等信息，对患者的首次确诊的时间和方式、ARDS药物治疗和非药物治疗进行总结和结构化表达。2专病数据模型构建ARDS数据模型构建参照ARDS数据字段集标准，构建ARDS专病数据模型，重点突出ARDS特有的诊断、检验检查和治疗手段等内容，将特有的内容设计成为高度结构化字段，满足临床研究数据搜索以及统计分析需求，总计约586个数据字段(实际字段以医院提供的数据为准)。覆盖以下数据来源：患者人口学信息、病历文书、病案首页、手术记录、用药记录、门诊处方、检验报告、微生物报告、CT检查、

7、普放检查、MRl检查、超声检查、心电图检查、生命体征、生存结局、生存随访、护理记录等。3数据驾驶舱数据概览支持展示所有患者在库内总体情况和各个模块分布统计，包括患者总数，就诊人次数据、时间范围等信息；疾病相关统计疾病相关信息统计，包括患者基本信息、临床信息以及治疗信息的统计分布；治疗相关分析数据驾驶舱可对治疗手段和治疗药物进行相关分析展示；患者新增趋势1、支持患者数据量历年趋势可视化展现；2、支持时间范围动态调整，以及年、月时间粒度调整；病历模块统计1、支持疾病数据各病历模块分布的可视化展现；自定义可视化指标1、支持自定义展示各维度指标数据，包括患者信息、就诊概要、入院记录、诊断、病理、影像学

8、检查、超声检查、手术记录等：2、支持用户定义指标与登录账户绑定联动；4智能搜索快捷搜索1、支持关键词检索，根据关键字快速搜索全库符合条件的患者；2、支持关键词智能标准词推荐，实现精准匹配和扩大召回范围（例如：搜索“肺癌”时，自动匹配“肺恶性肿瘤”的标准诊断词，实现数据标准词的归一检索）；3、支持搜索关键词应用自然语言技术实现自动切词，提升搜索准召率；4、支持搜索结果的二次筛选，可根据就诊时间、就诊类型、就诊科室、手术名称等类别进行数据筛选；条件搜索1、支持以条件树形式进行多级组合条件可视化筛选，组合条件之间支持“andornotw多层逻辑关系的嵌套组合；2、支持筛选条件在“纳入、排除”选项之间

9、灵活切换；3、支持多级搜索条件支持同患者、同就诊、同报告的数据维度筛选；4、支持根据搜索记过实时计算命中的患者数，用户可即刻感知搜索效果，根据需要及时调整筛选条件；5、支持智能病历筛选，对搜索结果进行二次的病历维度检索，例如在患者数据中筛选主诊断为肺癌的病历数据；6、支持搜索条件的精准检索和模糊检索两种方式，提升搜索效率；7、支持词频推荐与标准词推荐两种检索推荐方式，对库内核心检索模块（例如：诊断、手术、免疫组化等）通过归一检索策略，根据手术与操作ICD-9-CM-3s国际疾病分类第10版ICD-IO.国际疾病分类肿瘤学专辑第三版ICD-O-3、观测指标标识符逻辑命名与编码系统LoINCY2.

10、42、SNOMEDCT、MESH等对标准化词条、同义词条、父级词条聚合；事件-时间搜索1、支持库内百万级患者，通过多组“事件-时间”式条件进行患者筛选（例如：首次病理确诊后一个月内使用了某种新辅助治疗药物）2、支持事件筛选条件包括首次、末次、每次、第一次至第十次，精确定义前、后时间范围；3、支持灵活配置时间范围内多个限定条件极其之间的关系；4、支持定义事件在时间范围内发生的次数（例如：首次病理确诊后3个月内进行3次及以上手术的患者）；患者号精确搜索1、支持使用患者号、就诊号、住院号、门诊号、病案号进行批量精确搜索；2、支持Excel、txt文件列拷贝，自动识别患者号数据；搜索结果展不1、支持搜

11、索结果以可视化数据列表形式展现，展现内容包括患者的基本信息和关键疾病信息；2、支持按照各维度字段对患者列表进行排序；3、支持二次筛结果展示，按照患者诊疗维度的病历数据展现；搜索结果分析1、支持搜索结果的重点指标分析，展示各类关键疾病信息的统计分布；2、支持用户自定义分析各类指标的描述性统计分析；3、支持分析结果实时计算，并以图表形式进行可视化展现；4、支持定量指标分析结果的表格展现，包括有效数据、缺失数据均值、最大值、最小值、均值标准差、中位数（下四分位数上四分位数）：搜索结果导出1、支持对筛选结果做数据的表单导出，例如excel格式；2、支持用户选择对可溯源的患者编号、病案号、检查号进行脱敏

12、导出；筛选记录和筛选收藏夹1、支持记录筛选记录查看；支持保存常用的筛选条件进入收藏夹，可一键点击恢复筛选；2、支持通过可视化百分比查看条件检索进度及状态，对进行中与异常检索任务进行调度管理，并对完成的任务结果查看与复用；常用检索字段推荐支持检索字段个性化置顶推荐，在检索字段选择窗口，对高频、个性化等检索字段字段进行置顶，提升使用效率；5患者全景患者病历全景视图1、支持查看患者历次就诊的各类诊疗模块数据的在统一视图展现；2、支持门诊、住院等类别的各类原始文书和检验检查数据等数据分模块展现，包括门诊病历、住院病历、病案首页、检查记录、检验报告、医嘱记录等数据内容；3、支持患者病历数据模块结构化信息

13、展现，包括患者基本信息、入院记录、检验报告、检查报告、病理报告等内容；数据列表结构自定义1、支持患者就诊概要、检验报告、检查报告、病理报告等数据模块表格视图和摘要视图切换展现；2、支持表格视图展现模式下，自定义表头显示陷藏和表头拖拽排序；患者病案夹1、支持以患者就诊时间序列整合显示患者历次就诊列别及就诊信息摘要；2、支持按照就诊类型、就诊时间范围筛选，并可查看对应的病历详情；2、按时间顺序展示患者每份病案摘要，并可以查看病案详情；结构化数据溯源1、支持患者临床结构化数据与原始数据溯源，实现结构化结果在原文中的快速定位；2、支持结构化数据取值逻辑展现，包括取值来源、原始数据摘要展不等；3、支持结

14、构化数据一键定位取值原文，并实时高亮显示显示标记结果；检验指标时序图支持各类检验指标以时序图的形式进行可视化展现；6数据导出宽表数据导出支持宽表导出，根据基线时间将数据整理成一个患者一行数据，满足SPSS格式要求,并支持导出效果的在线预览；表单数据导出支持表单导出，支持患者数据按照人口学信息、入院记录、检验报告等模块进行模块筛选和对应字段筛选，可进行导出效果的在线预览，导出结果以Excel文件按照模块区分形式进行下载到本地；数据导出管理1、支持数据导出申请与审批，根据用户的数据权限区分数据审批流程，保证数据使用安全性；2、支持对患者编号、门诊号、住院号、检查号等编号进行脱敏导出；3、支持数据多

15、次下载，审批通过的数据可进行多次下载；7项目管理项目管理1、支持对项目的增删改，支持查看所有项目的概要信息，支持按照项目名称进行搜索；2、支持项目成员权限管理；项目筛选支持按照项目名称搜索项目，以及项目分类方式进行筛选；8回顾性科研项目研究队列管理1、支持以条件筛选和患者ID的搜索方式筛选符合入组的患者，并将搜索出的患者作为队列保存进项目；2、支持列表字段搜索、升序、降排等便捷数据筛选；3、支持查看和调整队列对应的筛选条件，根据修改的后筛选结果更新研究数据，并提供增了更新和覆盖更新两种模式；研究指标制备1、支持变量分组管理，可设置多个变量组分别筛选研究变量，并可自定义变量组名称；2、支持基线变量设置，并可根据首次、末次、前后时间区间自动完成基线指标降维；3、支持研究变量填充率计算，并可根据首次、末次、第一次至第十次、最近、全部等方式进行数据取值；4、支持用户自定义添加指标，可设置指标的默认规则，比如默认值、备选值等；5、支持数据列表筛选，精确定位到需要进行数据编辑/补录的患者，方便后续数据编