主要动植物功能基因组研究重大项目课题申请指引.docx

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1、附件1:863支配现代农业技术领域”主要动植物功能基因组探讨”重大项目课题申请指南一、指南说明动植物功能基因组探讨为人类相识生物、改造生物供应重要基础,已成为农业商技术的重要组成部分,同时也是农业生命科学领域国际竞争的焦点。本项目依据我国经济社会,特殊是农业农村经济发展的重大需求和现有探讨开发基础,以水稻和家蚕为支持重点,同时支持有较好探讨基础的主要动植物,以获得一大批有重要应用价值的基因产权为主要目标,系统开展功能基因组探讨,为主要动植物品种改良,实现“高产、优质、抗逆、生态、平安”发展目标供应基因资源和学问基础。项目利用“十五”建立的水稻功能基因组的技术平台,系统开展水稻产量、品质、抗病抗

2、逆、养分高效性状的功能基因组探讨,克隆验证新基因和调控因子,应用芯片技术建立水稻重要农艺性状的全基因组表达谙,并开展比较基因组学探讨和第3、4染色体功能基因的系统鉴定;利用水稻、拟南芥等模式植物功能基因组的技术平台,开展小麦、玉米、棉花、油菜、大豆、花生、番茄等作物的功能基因组探讨,克隆骁证重要农艺性状基因:建立家蚕和家鸡的功能基因组探讨技术平台,分别克隆与家蚕丝蛋白质合成、性别确定、发育变态、分子免疫和对微生物反抗性、鸡的生长、品质、抗性、繁殖等重要经济性状相关的重要功能基因和调控因子。项目的总体目标为:建立并完善水稻、家蚕大规模地开展功能基因组探讨的技术体系:建立水稻产量、品质、抗逆、素分

3、高效等重要性状的全基因组表达谙,揭示表达调控网络,初步弄清水稻第3、4两条染色体大部分基因的功能;克隆水稻、小麦、玉米、棉花、大豆、油菜、花生、番茄、家蚕、家鸡等物种新基因和调控因子1700个以上,其中50个以上有重要应用前景;申请基因(含调控因子)专利450个以上,发表商水平探讨论文400篇以上。通过项目的实施,使我国水稻功能基因组探讨领域整体达到国际领先水平;小麦、玉米、大豆、棉花、油菜、花生、番茄等作物的功能基因组探讨具备肯定的规模,并在国际上形成局部优势;建立较完善的家蚕功能基因组探讨的技术平台,家鸡功能基因组探讨取得较大进展,形成进入国际先进水平的实力。此次发布的是现代农业技术领域”

4、主要动植物功能基因组探讨”重大项目的课题申请指南,支配国拨经费1.7亿。二、指南内容果题1.水稻产量性状的功能并因组探讨探讨目标:分别克隆限制水稻产量和杂种优势的基因并验证功能。探讨内容:通过对课题前阶段产生的突变体库进行系统筛选,获得水稻株型、穗型、粒重、生育期等性状的突变体,分别克隆基因及调控因子:系统建立产量性状和杂种优势的基因表达谙,鉴定特异表达基因的功能,分析其对提高产量和增加杂种优势的价值;图位克隆法分别克隆产量性状基因(QT1.s)o考核指标:分别克隆调控水稻株型、穗型、粒重、生育期等性状的基因及调控因子300个以上,其中有重要应用前景基因10个以上,申请专利120项以上,发表高

5、水平探讨论文70篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨2700-2800万。课题2.水稻品质性状的功能基因组探讨探讨目标:分别克隆限制稻米品质的基因并验证功能。探讨内容:通过对课题前阶段产生的突变体库的系统筛选,获得稻米外观品质、食味品质、蒸煮品质、养分品质等性状的突变体,分别克隆基因及调控因子;图位克隆法分别克隆稻米品质基因(QT1.s)。考核指标:分别克隆调控稻米外观品质、食味品质、蒸煮品质、养分品质等性状的基因及调控因子300个以上,其中有重要应用前景基因5个以上,申请专利80项以上,发表高水平探讨论文60篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨2700-2800万。果题3.水稻抗逆和养分性状

6、功能基因组探讨探讨目标;分别克隆限制水稻生物和非生物逆境、氮磷养分汲取和利用效率的基因并验证功能。探讨内容:通过对课题前阶段产生的突变体库的系统筛选,获得水稻抗病、抗旱、抗盐、氮磷养分高效等性状的突变体,分别克隆基因及调控因子;系统建立病原、逆境、低氮低磷等条件胁迫的基因表达谙,系统鉴定胁迫条件下特异表达基因的功能,分析其对提高抗逆和养分利用效率的价值;图位克隆法分别克隆抗逆和养分性状基因(QT1.s)o考核指标:分别克隆调控抗病、抗旱、抗盐、氮磷养分高效等性状的基因及调控因子300个以上,其中有重要应用前景基因10个以上,申请专利100项以上,发表高水平探讨论文70篇以上。支持年限:5年经费

7、来源:国拨2700-2800万。果题4.水稻笫3、4染色体基因的功能分析探讨目标:确定第3、4染色体大部分基因的表型效应。探讨内容:通过比较基因组学分析,系统分析和鉴定水稻3.4号染色体功能基因;突变体库(项目十五期间我国自行构建及必要的国外引进)与RNAi及其它基因功能分析技术相结合,田间种植并辅之以干旱、低氮、低磷等胁迫条件筛选,系统鉴定基因功能。考核指标:初步阐明水稻3、4号染色体大部分基因对表型的影响,分别新的功能基因100个以上,申请专利20项以上,发表高水平探讨论文5篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨900TOoO万。课题5.水稻功能基因组探讨技术和信息平台的完善探讨目标:建立完

8、善水稻功能基因组探讨平台技术。探讨内容:繁殖、整理好已建成的突变体库,进一步分别侧翼序列,使70%以上的转基因株系有侧翼序列的标签;进一步分别克隆全长cDNA,使全长CDM克隆总数覆盖基因数的90%;完善水稻功能基因组的各种数据库及生物信息分析系统和设施;建立基因组水平DNA甲基化分析技术、组蛋白甲基化和乙酰化修饰等功能基因组新的平台技术。考核指标:数据完整、能对外刚好供种的突变体株系20万个,其中70%有侧翼序列,覆盖全基因组90%以上基因的全长cDNA,较完善的稻属比较基因组学数据库和技术平台。支持年限:5年经费来源:国拨900TOOO万。课题6.小麦抗病性状功能基因组探讨探讨目标:分别克

9、隆限制小麦主要病害的抗病基因并脸证功能。探讨内容:以小麦对白粉病、赤霉病、条锈病、纹枯病和黄矮病的抗性为探讨对象,利用具有我国特色的遗传资源,探讨小麦基因组中的抗病基因(R基因)、抗病信号传导基因、防卫反应基因的数量、结构与基因组分布,鉴定和分别与抗病过程紧密相关的关键新基因,明确关键新基因的物理定位、表达调控规律、生物学功能以及经济利用价值。考核指标:获得与小麦抗白粉病、赤您病、条锈病、纹枯病和黄矮病相关的基因300个以上,关键新基因10个以上,其中3个具有重要应用前景,申请专利10项以上,发表高水平探讨论文20筲以上。支持年限:5年经费来源:国拨450-550万。课题7.小麦养分高效利用性

10、状功能基因组探讨探讨目标:分别克隆限制小麦氮磷汲取利用效率基因并验证功能。探讨内容:以小麦对磷和氮高效利用性状为探讨对象,利用我国特有的遗传资源,鉴定和分别与磷、氮高效利用亲密关联的相关和关键新基因,明确关键新基因的物理定位、表达调控规律、生物学功能以及经济利用价值。考核指标:获得与小麦高效利用磷、氮养分元素相关的基因100个以上,关键新基因5个以上并验证其功能,其中2个具有重要应用前景。申请专利10项以上,发表高水平探讨论文10篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨450-550万。课题&玉米功能基因组探讨平台建设和农艺性状基因的克隆探讨目标:获得玉米全长CDNA库和突变体库,克隆农艺性状基因

11、。探讨内容:以我国玉米生产上广泛应用的自交系为材料构建全长cDN文库2-3个,进行测序和生物信息学分析,供基因克隆和表达分析运用。同时,通过转座子(特殊是Mu)或农杆菌介导转座子插入等多种方法,建立我国的玉米突变体库,获得独立的突变体2000个以上,并对突变体进行初步的遗传分析。在此基础上,克隆与玉米产量等重要农艺性状相关的基因,并进行基因的表达特性和功能分析。考核指标:获得玉米全长CDNA克隆和序列信息5000条;获得玉米突变体材料2000份,应用突变体分别克隆农艺性状基因5个以上。申请专利10项以上,发表高水平探讨论文10篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨200-300万。课题9.玉米抗

12、逆、抗病、品质的功能基因组探讨探讨目标:分别克隆玉米抗烧、抗逆、品质基因并验证功能。探讨内容:通过基因表达谱分析、比较基因组和同源克隆等方法筛选玉米抗逆、抗病和品质等候选基因。在此基础上,进行基因表达产物分析、转基因功能脸证(过量表达、基因缄默技术和RNA干扰技术等)、转基因模式植物和转基因玉米的生理遗传学分析等,确定目标基因的功能,进而分析这些基因在玉米遗传改良中的利用价值和途径。考核指标:鉴定出调控玉米抗逆、抗病、品质等重要农艺性状的候选基因100个,包括具有重要应用价值的新基因5个以上。申请基因(含调控因子)专利10个,发表高水平探讨论文20篇。支持年限:5年经费来源:国拨250-350

13、万。课题10.棉花抗衰相关功能基因的克隆与验证探讨目标:分别克隆棉花抗旱衰、抗逆基因并验证功能。.探讨内容:构建逆境诱导的全长CDNAs文库,筛选与抗逆相关基因,探讨基因表达;分别鉴定与抗旱衰、抗旱、耐盐碱的相关基因,探讨其表达模式,阐述棉花抗早衰、抗旱、耐盐碱的分子机制;分别特异启动子,并进行功能验证。考核指标:鉴定抗旱衰、抗旱、耐盆碱特异表达的全长cDNA1000条;获得在棉花早衰、抗旱、抗盐中具有利用价值的关键基因5个以上,其中有重大应用前景的功能基因3个以上;分别特异启动子2-3并验证其功能。申请专利5个;发表高水平论文10篇。支持年限:5年经费来源:国拨200-300万。课题11.棉

14、花纤维品质相关功能基因的克隆与验证探讨目标:分别克隆棉花纤维品质基因并验证功能探讨内容:构速棉花纤维发育时期的全长CDNA文库,箍选与棉花纤维品质相关的基因,探讨其表达漕;克隆棉花纤维起始、延长、加厚(生长素合成、乙用合成、延展蛋白、纤维素合成酶等)相关的基因,探讨其在棉花纤维和品质形成中所起的作用;分别棉花纤维发育基因表达的调控因子、特异启动子,并探讨其表达模式。考核指标:鉴定棉纤维突起及快速伸长期特异性表达的全长CDNA100O个,获得纤维主要发育时期的关键基因5个以上,并探讨其功能,其中有重大应用前景的功能基因2个以上。申请专利5项;发表高水平论文10篇。支持年限:5年经费来源:国拨20

15、0-300万。课题12.大豆优质基因的克隆及功能探讨探讨目标:分别克隆大豆蛋白质、油份形成关键基因并验证功能。探讨内容:构建大豆种子发育时期全长CDNA文库,筛选与大豆蛋白质和油分形成相关的全长cDNA,探讨基因的表达谱;利用模式植物和大豆基因组的共线性关系,筛选大豆蛋白质和油分形成的关键基因,并进行功能探讨。考核指标:获得品质相关全长CDNA1.OOO条以上;克隆限制大豆油分和蛋白质相关基因30个,鉴定10个以上键基因并险证其功能,发掘有重要应用价值的基因12个;申请专利10个以上,发表高水平论文10篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨250-350万。课题13.大豆抗病、抗逆及广适应性基因

16、的克隆及功能探讨探讨目标:分别克隆大豆抗病、抗逆及广适应性基因并验证功能。探讨内容:利用遗传作图、TI1.1.ING和模式植物生物信息分析等方法,克隆与生态适应性相关的基因,筛选出限制大豆开花及光周期反应的关键基因,探讨其功能并阐明其信号传导网络;克隆抗病、抗逆相关基因,分析等位基因的变异,鉴定关键基因的功能并阐明其分子机理。考核指标:鉴定与大豆病害(大豆花叶病毒病、大豆疫霉根腐病等抗性)、大豆生态适应性(光周期反应、开花)相关基因20个以上;获得抗病、广适应性关键基因5个以上,并验证其功能,其中有重大应用价值新基因12个:申请专利10个以上,发表高水平论文10篇以上。支持年限:5年经费来源:国拨250-350万。课题14.油菜抗

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